かなり困ったので対処法をメモ。下記ページの中に解決手段の記載があった。
設定ボタンが開かない タブを左クリックすると閉じてしまう ブックマークのフォルダを押すと全てのブックマークが開いてしまう
この書き込み、
マウスのショートカットでの通り、マウスの真ん中にあるホイールボタンを何度か押すとこの現象が治るので
「マウスの中央ボタンかマウスホイールでタブをクリックする→クリックしたタブを閉じます。」
http://www.google.com/support/chrome/bin/static.py?hl=ja&page=guide.cs&guide=25799&from=25799&rd=1
がありますが、
マウスのホイールボタンが勝手にオンのままになってませんでしょうか?
その場合、もう一度(もしくは何回か)ホイールボタンを押せば、オンの状態が解除され、タブがクリックで閉じる事もなくなります。
設定も開けるようになるはずです。
参考:http://www.google.com/support/forum/p/chrome/thread?tid=77ce16d1ca581be6&hl=ja
試してみるとよい。しかしこんな機能、仕様として用意する必要あるのか?迷惑なだけだぞ。